生物信息學(xué)導(dǎo)師有哪些 華科的田巖導(dǎo)師

午夜聽雨2022-08-03 12:10:37981

武漢大學(xué)生命科學(xué)院遺傳學(xué)導(dǎo)師信息,南開大學(xué)生科院生物工程專業(yè)碩士有哪幾個導(dǎo)師,鐘揚的復(fù)旦大學(xué)教授,求教生物信息學(xué)研究生學(xué)長,怎么選擇導(dǎo)師?華科大薛宇導(dǎo)師,生物信息學(xué)領(lǐng)域中,有哪些不得不知道的大牛教授/研究者。

本文導(dǎo)航

安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)院教師介紹

模式植物遺傳學(xué)副教授:章志宏

章志宏,男,武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師。專業(yè)與研究方向為植物基因組學(xué)與分子改良。

1979-1983年,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)系本科生,畢業(yè)后獲理學(xué)學(xué)士學(xué)位

1983-1988年,湖北省農(nóng)業(yè)廳糧食生產(chǎn)處工作,從事水稻生產(chǎn)技術(shù)示范推廣

1988-1991年,武漢大學(xué)遺傳學(xué)碩士研究生,畢業(yè)后獲碩士學(xué)位、并留校任教

1992年晉升講師,2002年晉升副教授,2004年獲遺傳學(xué)博士學(xué)位

2008年晉升教授

利用植物基因組學(xué)的原理、方法和數(shù)據(jù)庫,解析水稻重要性狀(產(chǎn)量、品質(zhì)和抗性等)的遺傳基礎(chǔ),揭示重要性狀的遺傳網(wǎng)絡(luò);研究基因互作、基因與環(huán)境互作在性狀發(fā)育中的作用;發(fā)掘優(yōu)異功能新基因,通過分子標記輔助選擇和基因工程等手段,進行水稻品種的分子改良,培育水稻新品種。

群體與數(shù)量遺傳學(xué)教授 :胡中立

職稱:教授、博士生導(dǎo)師

學(xué)位:博士

博士學(xué)位授予學(xué)校:武漢大學(xué)

專業(yè):遺傳學(xué)

研究方向

1、植物資源生物學(xué)與生物技術(shù):植物資源遺傳與改良,植物資源開發(fā)利用。

2、植物分子細胞遺傳學(xué):植物分子核型分析,染色體分揀及專性文庫的構(gòu)建與利用。

3、生物信息學(xué)和數(shù)量遺傳:統(tǒng)計基因組學(xué)與QTL分析,植物基因與基因組進化分析,基因組作圖。

科研項目

2000年以來曾先后主持及完成國家級科研項目6項,省、部級科研項目10項。

南開大學(xué)微生物研究生排名

現(xiàn)有一級學(xué)科:生物學(xué)(0710)

下屬二級學(xué)科包括以下8個:

植物學(xué)(071001)

動物學(xué)(071002)

微生物學(xué)(071005)

遺傳學(xué)(071007) 細胞生物學(xué)(071009)

生物化學(xué)與分子生物學(xué)(071010) 生態(tài)學(xué)(071012)

生物信息學(xué)(071020)另有高分子化學(xué)與物理(070305)(教育部生物活性材料重點實驗室)是屬于化學(xué)一級學(xué)科下的二級學(xué)科

抱歉。沒有找到生物工程專業(yè)

下面是我找到的老師

饒子和

性 別:男

職 稱:教授

所屬部門:生物化學(xué)和分子生物學(xué)系

招生專業(yè):

研究方向:

::教師簡介::

分子生物物理和結(jié)構(gòu)生物學(xué)家,中國科學(xué)院院士,第三世界科學(xué)院院士,全國人大代表,中國科協(xié)常委,中國生物物理學(xué)會理事長,國際純粹與應(yīng)用生物物理聯(lián)合會(IUPAB )理事會執(zhí)行理事。

主要從事與重要病毒和腫瘤相關(guān)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能以及創(chuàng)新藥物的研究,取得了一系列重要的原創(chuàng)性的成果,在SARS病毒、禽流感病毒和膜蛋白的三維結(jié)構(gòu)與功能的研究中做出了突出貢獻。在國際學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表研究論文218篇,其中Nature/Cell系列論文13篇,包括Nature 3篇,Cell 2篇,被引用超過2000次,同時申請并獲發(fā)明專利6項。

王磊

性 別:男

職 稱:教授

所屬部門:微生物學(xué)系

招生專業(yè):微生物學(xué)、生物化學(xué)、生物信息學(xué)

研究方向:微生物遺傳與進化、進化基因組學(xué)、微生物表面抗原功能基因

董金堂

性 別:男

職 稱:教授

所屬部門:遺傳學(xué)和細胞生物學(xué)系

招生專業(yè):遺傳學(xué)、分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)

研究方向:腫瘤發(fā)生和發(fā)展的分子機制研究,涉及發(fā)現(xiàn)和鑒定腫瘤相關(guān)基因,并對個別基因進行生化和分子通路的研究。

鐘揚校長

湖南新寧人,1964年5月出生。中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)少年班畢業(yè),無線電電子學(xué)工學(xué)學(xué)士;日本國立綜合研究大學(xué)院大學(xué)(The GraduateUniversity for Advanced Studies)生物系統(tǒng)科學(xué)博士。1984 - 1999年任中國科學(xué)院武漢植物研究所研究實習(xí)員、助理研究員、副研究員(1992)、研究員(1996)、副所長(1997);1992-1998年曾在University of California-Berkeley和Michigan State University進行合作研究4年;2002-2006年曾兩次任日本文部科學(xué)省統(tǒng)計數(shù)理研究所外國人客員教授;2000年起任復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授,植物學(xué)和生物信息學(xué)博士生導(dǎo)師。現(xiàn)為復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院常務(wù)副院長,生物多樣性與生態(tài)工程教育部重點實驗室副主任,上海生物信息技術(shù)研究中心副主任;兼任北京大學(xué)理論生物學(xué)中心教授、西藏大學(xué)教授等。中國生物物理學(xué)會生物信息學(xué)與理論生物物理學(xué)專業(yè)委員會主任,中國植物學(xué)會系統(tǒng)與進化植物學(xué)專業(yè)委員會副主任。 2001年獲中國高校自然科學(xué)一等獎 (排名第二)2015年9月17日,由中央電視臺和光明日報社聯(lián)合主辦的2015“尋找最美教師”大型公益活動“被推選為活動“特別關(guān)注教師”。 [1] Jung, S., Perkins, S., Zhong, Y., Pramanik, S., Beaman, J. H. 1995. A new data model for biological classification. Computer Applications in Biosciences (CABIOS) 11: 237-246.[2] Zhong, Y., Jung, S, Pramanik, S, Beaman, J H. 1996. Data model and comparison and query methods for interacting classifications in a taxonomic database. Taxon 45(2): 223-241.[3] Zhong, Y., Meacham, C. A., Pramanik, S. 1997. A general method for tree-comparison based on subtree similarity and its use in a taxonomic database. BioSystems 42: 1-8.[4] Zhong, Y., Luo, Y., Pramanik, S., Beaman, J. H. 1999. HICLAS: a taxonomic database system for displaying and comparing biological classification and phylogenetic trees. Bioinformatics 15(2): 149-156.[5] Zhong, Y., Shi, S. H., Tang, X. H., Huang, Y. L., Tan, F. X., Zhang, X. Y. 2000. Testing relative evolutionary rates and estimating divergence times among six genera of Rhizophoraceae using cpDNA and nrDNA sequences. Chinese Science Bulletin 45: 1011-1015.[6] Shi, S., Jin, H., Zhong, Y., He, X., Huang, Y., Tan, F., Boufford, D. E. 2000. Phylogenetic relationships of the Magnoliaceae inferred from cpDNA matK sequences. Theoretical and Applied Genetics 101: 925-930.[7] Sang, T., Zhong, Y. 2000. Testing hybridization hypotheses based on incongruent gene trees. Systematic Biology 49: 422-434.[8] Cui, X. H., Zhong, Y., Chen, J. K. 2000. Influence of a catastrophic flood on densities and biomasses of three plant species in Poyang Lake, China. Journal of Freshwater Ecology 15: 537-541.[9] He, Z. C., Zhang, X. Y., Zhong, Y., Ye, L. 2000. Phylogenetic relationships of Actinidia and related genera based on micromorphological characters of foliar trichomes. Genetic Resources and Crop Evolution 47: 627-639.[10] Wang, J. B., Wang, C., Shi, S. H., Zhong, Y. 2000. ITS regions in diploids of Aegilops (Poaceae) and their phylogenetic implications. Hereditas 132: 209-213.[11] Wang, J. B., Wang, C., Shi, S. H., Zhong, Y. 2000. Evolution of parental ITS regions of nuclear rDNA in allopolyploid Aegilops (Poaceae) species. Hereditas 133: 1-7.[12] Zhong, Y., Zhang, L., Su, D. M. 2000. Collaborations tailored for bioinformatics projects. Science 290: 2074. (Letter)[13] Shi, S., Huang, Y., Zhong, Y., Du, Y., Zhang, Q., Chang, H., Boufford, D.E. 2001. Phylogeny of the Altingiaceae based on cpDNA matK, PY-IGS and nrDNA ITS sequences. Plant Systematics and Evolution 230: 13-24.[14] Wu, J., Liang, Y., Zhong, Y., Fu, C., Chen, J. 2002. Advances in phylogenetic studies of Nematoda. Chinese Science Bulletin 47: 10-15.[15] Huang, Y., Shi, S., Zhong, Y., Tan, F. 2002. A new method for preparation of template DNA for PCR from special plant materials. Chinese Science Bulletin 47: 725-727.[16] Shi, S., Zhong, Y., Huang, Y., Du, Y., Qiu, X., Chang, H. 2002. Phylogenetic relationships of the Rhizophoraceae in China based on sequences of the chloroplast gene matK and the internal transcribed spacer regions of nuclear ribosomal DNA and combined data set. Biochemical Systematics and Ecology 30: 309-319. 等。 【1】 鐘揚, 陳家寬, 黃德世, 1990.。數(shù)量分類的方法與程序。武漢大學(xué)出版社。【2】 鐘揚, 李偉, 黃德世, 1994。分支分類的理論與方法。科學(xué)出版社。【3】 鐘揚, 張亮, 趙瓊等, 2001。簡明生物信息學(xué)。高等教育出版社。【4】 鐘揚, 張文娟, 王莉,趙佳媛, 2005?;蛴嬎?。上??萍冀逃霭嫔??!?】 李偉, 鐘揚編譯, 1992。水生植被研究的理論與方法。華中師范大學(xué)出版社。【6】 M. Nei, S. Kumar著, 呂寶忠, 鐘揚, 高莉萍等譯, 2002。分子進化與系統(tǒng)發(fā)育。高等教育出版社?!?】 D. W. Mount著, 鐘揚, 王莉, 張亮等譯, 2003。生物信息學(xué)。高等教育出版社?!?】 J. D. Watson著, 鐘揚, 沈瑋, 趙瓊, 王旭譯, 2003?;? 女郎, 伽莫夫。上海科技教育出版社?!?】 P. Reilly著, 鐘揚, 李作峰, 趙佳媛, 趙曉敏譯, 2005。林肯的DNA。上海科技教育出版社。

生物信息學(xué)研究生報考條件

學(xué)?,F(xiàn)在研究生分導(dǎo)師一般是三種情況,一種是先錄取后分導(dǎo)師,一種是錄取前就要求先填報志愿。你的情況應(yīng)該是屬于前一種的,因為顯然你現(xiàn)在導(dǎo)師還沒有定。

一般如果導(dǎo)師已經(jīng)定了的話,那就需要在暑假的時候先跟導(dǎo)師聯(lián)系一下,因為有的導(dǎo)師比較喜歡在暑假的時候先讓新生在自己實驗室干干活,適應(yīng)一下環(huán)境。象你這種導(dǎo)師最后還沒有分配好的,最好就先別找了,除非你很確定人家最后會要你,否則很容易陷進學(xué)院人事斗爭的陷阱里,作用反而適得其反。

選博導(dǎo)還是碩導(dǎo)的問題其實是個偽命題,因為這兩者根本不在一個水平線上。博導(dǎo)會有比碩導(dǎo)多的多的研究課題和研究經(jīng)費,在博導(dǎo)的手下不但活會比較多,而且外快也會比較多。

但如果博導(dǎo)有行政職務(wù)的話,除非你本來就是為了畢業(yè)找好工作,不在乎研究生期間能學(xué)到什么的話,不建議選。因為有行政職務(wù)的一般會比較忙,應(yīng)酬比較多,你基本上學(xué)術(shù)上得不到多少指點,只能靠自己摸索了。

我當(dāng)年就是圖名氣選了個博導(dǎo),結(jié)果雖然活確實比較多,但基本上是干苦力的,感覺跟老板雇的員工一樣,沒學(xué)到什么.

華科的田巖導(dǎo)師

薛宇,男,1980 年6 月出生,分子細胞生物學(xué)博士,華中科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師,入選教育部“新世紀優(yōu)秀人才支持計劃”。主要研究方向為蛋白質(zhì)共價修飾的生物信息學(xué)分析,近年來緊密圍繞共價修飾底物和位點預(yù)測、修飾調(diào)控分析以及修飾組學(xué)數(shù)據(jù)處理等重要科學(xué)問題,采用由點及面、層層推進的研究策略,取得了階段性的研究成果。與合作者設(shè)計了新穎的GPS (Group-based Prediction System, 分組預(yù)測系統(tǒng)) 系列算法,構(gòu)建了多種預(yù)測共價修飾底物和位點的計算工具、軟件和數(shù)據(jù)庫;采用比較基因組學(xué)和統(tǒng)計學(xué)等方法,從蛋白質(zhì)組層面系統(tǒng)分析了共價修飾潛在調(diào)控機制和功能,初步提出了本領(lǐng)域的標準化設(shè)計和分析流程;結(jié)合磷酸化組學(xué)數(shù)據(jù),初步揭示遺傳多樣性改變蛋白質(zhì)共價修飾狀態(tài),是其影響關(guān)鍵生物學(xué)過程和通路潛在分子機制;利用乙?;M學(xué)數(shù)據(jù),初步模擬人類乙?;{(diào)控網(wǎng)絡(luò),提出由乙酰轉(zhuǎn)移酶、底物和去乙酰酶組成的“三者關(guān)系”(Triplet relationship) 是構(gòu)成人類乙?;{(diào)控網(wǎng)絡(luò)的基本單元。以主要作者 (第一或通訊) 身份發(fā)表SCI 收錄論文近40篇,被他人引用~700次。應(yīng)邀為InTech 出版社“Bioinformatics - Experimental Biology Systems”一書撰寫一個章節(jié)。獲國家自然科學(xué)基金、科技部和中國科學(xué)院等資助,獲計算軟件著作權(quán)登記證書四項。

生物信息學(xué)未來的看法

作者:知乎用戶

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來源:知乎

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genomics或者說測序依然是很大的領(lǐng)域,其中的方向細分依然是很多的。genomics整體可以分成兩大類,一類主要做方法,一類主要做生物。前者一般使用public data做一些方法,后者主要使用現(xiàn)有的技術(shù)研究生物問題。如果說大牛一般都在后一類里面。但是也會有很多不同的方向,比如研究rna的,dna的,基因調(diào)控的。所以最好根據(jù)自己關(guān)注的方向去找。

一個很直接找genomic方向大牛的方法就是看encode,roadmap和4D nuckesomes這些大genomic cobsortium的主要pi。當(dāng)然也有很多牛人不在這些項目里面。下面簡單說幾個比較熟悉的,歡迎糾正和補充。

Eric Lander

Broad的創(chuàng)始人,人類基因組計劃發(fā)起人之一,不過現(xiàn)在自己lab似乎不做大多了,但很多broad的paper還會掛名。

John Rinn

Broad的PI,研究lncRNA。最早發(fā)現(xiàn)了H19。

Michell Guttman

Eric Lander的學(xué)生,和John Rinn一起發(fā)現(xiàn)了lncRNA,在clatech獨立不久。

Howard Chang

主要研究RNA,John Rinn的postdoc老板。

Michael Synder

研究基因調(diào)控,具體方向很多,組特別大。

Job Dekker

3D genome領(lǐng)域的開拓者,3C,5C和HiC的發(fā)明者。

Bing Ren

最早開發(fā)了chip-chip技術(shù),研究enhancer,現(xiàn)在做更多3D genome。

Joe Ecker

最早是植物領(lǐng)域的大牛,后來轉(zhuǎn)到做甲基化。

Chuan He

化學(xué)出身,之前做DNA甲基化,現(xiàn)在開創(chuàng)了RNA甲基化的新領(lǐng)域。

Mark Gersrein

比較少的主要做計算的大牛,各種network和system biology

Menolis Kellis

Eric Lander的學(xué)生,主要做計算也做實驗,各種consortium都很活躍。

John Stam

名字很長很難寫,主要做DHS,當(dāng)然還有很多其他方向。

Shirely Liu

主要做計算,lab開發(fā)了MACS

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